iii
Introduction to Flow Cytometry: A Learning Guide
Table of Contents
Preface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . v
For More Information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . v
Chapter 1 Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
Review Questions: Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
Chapter 2 Fluidics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
Review Questions: Fluidics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
Chapter
3
Generation of Scatter and Fluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
3.1
Light Scatter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Review Questions: Light Scatter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
3.2
Fluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
Review Questions: Fluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
Chapter
4 Optical System
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
4.1
Optical Bench . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
Review Questions: Optical Bench . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
4.2
Optical Filters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
Review Questions: Optical Filters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
4.3
Signal Detection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
Review Questions: Signal Detection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
4.4
Threshold . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
Review Questions: Threshold . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
Chapter
5 Data Analysis
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
5.1
Data Collection and Display . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Review Questions: Data Collection and Display . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
5.2
Gating . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Review Questions: Gating . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
5.3 Data Analysis for Subsetting Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
5.4 Data Analysis for Other Applications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
Review Questions: Data Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36